始于1926年，其前身是北平同仁堂京都乐家老铺南京分号，因其创办人姓乐而得名，集合中医诊疗、保健调理、养生指导为一体的高品质国医馆
南京同仁堂药业有限责任公司位于美丽的雨花台风景区西麓，是南京市一家以现代科技生产古方传统品种和综合新剂型，集科、工、贸为一体的中药企业。
南京同仁堂药业有限责任公司历史悠久，其前身是北平同仁堂京都乐家老铺南京分号，于1926年在南京开业，1955年更名为公私合营南京同仁堂国药号股份有限公司，1957年定名为南京同仁堂制药厂。1998年，改制组建南京同仁堂药业有限责任公司。
2000年按国家行业管理的要求，公司投巨资进行GMP改造，引进了片剂、丸剂、胶囊剂、颗粒剂、口服液等剂型的生产线。2002年11月，九个剂型一次性通过国家GMP认证。公司持续获得国家“高新技术企业”殊荣。2018年，公司在浦口南京生物医药谷建成占地154亩新厂区，生产自动化程度显著提升、产品质量精确可控，加快了企业科技发展步伐，使中成药的技术含量得到大幅度提升。
在继承和发扬传统精粹安宫牛黄丸、牛黄清心丸、大活络丸、石斛夜光丸、乌鸡白凤丸、六味地黄丸的同时，企业相继自行研制、开发了一批颇具特色的新产品。
“炮制虽繁，必不敢省人工；品味虽贵，必不敢减物力”，这是同仁堂传承百年的古训；“同修仁德、济世养生”、“修合无人见，存心有天知”则是企业奉行的准则。公司生产产品在历年的市场抽查中，均无发现不合格产品，企业多次荣获省、市优秀管理企业、文明单位。
2013年南京同仁堂深化改革，创新营销模式，在短时间内完成组建了3000多人的专业销售团队。数据显示，2013-2018年，南京同仁堂复合增长率达到70%以上。
作为承载中华文明，传承匠心精神，凝聚先辈智慧，延续工艺技术，体现诚信经营的重要载体，南京同仁堂已肩负起新时期的历史使命。未来，南京同仁堂将以崭新的姿态和风采，顺应市场需求，进行改革创新，让“老字号”有“新内容”“新亮点”“新优势”，焕发生机，重放光彩，成为国家的荣耀和中国的名片，为中国医药老字号品牌的群体崛起贡献自己的力量。
